107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2781 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  100 
 
 
378 aa  778    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  30.38 
 
 
433 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  30.87 
 
 
432 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.54 
 
 
432 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 
424 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
430 aa  122  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
463 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
415 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0143  hypothetical protein  29.55 
 
 
369 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0148  capsular polysaccharide synthesis enzyme Cap5I  29.55 
 
 
369 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  25.53 
 
 
484 aa  93.6  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
374 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  23.82 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  23.69 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 
445 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  23.8 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3903  hypothetical protein  26.12 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20960  hypothetical protein  22.07 
 
 
373 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
859 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08670  hypothetical protein  24.91 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  22.99 
 
 
417 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
366 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2760  hypothetical protein  22.91 
 
 
413 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.385888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
416 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
418 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  22.94 
 
 
861 aa  58.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  22.25 
 
 
371 aa  56.6  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0362  hypothetical protein  25.27 
 
 
368 aa  56.2  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  22.17 
 
 
353 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
414 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  21.2 
 
 
516 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.76 
 
 
403 aa  53.1  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.76 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
408 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1301  glycosyltransferase-like protein  33.63 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.922127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  25.39 
 
 
407 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  24.1 
 
 
343 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  21.82 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
507 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
410 aa  50.4  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2899  group 1 glycosyl transferase  25.83 
 
 
390 aa  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00186189  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4413  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 
420 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4476  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 
420 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
404 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
412 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  19.09 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  21.53 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  22.82 
 
 
418 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 
481 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  20.98 
 
 
392 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3501  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3949  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256853  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
360 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  30.89 
 
 
396 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  21.24 
 
 
381 aa  47  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
390 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  21.38 
 
 
522 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
411 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  21.43 
 
 
384 aa  46.2  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2253  hypothetical protein  21.08 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0192058  hitchhiker  0.00258376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  21.53 
 
 
447 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  26.36 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  22.08 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1950  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
405 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 
417 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  23.57 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 
368 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  25.12 
 
 
420 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3783  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653155  normal  0.567349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  20.35 
 
 
517 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  26.27 
 
 
362 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
426 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  24.12 
 
 
419 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  23.78 
 
 
411 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 
370 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 
477 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
443 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  22.3 
 
 
431 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 
383 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>