198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1869 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 411 aa  844    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  48.41 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  51.12 
 
 		 405 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  44.72 
 
 		 414 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  45.18 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  45.25 
 
 		 416 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  44.32 
 
 		 419 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  35.94 
 
 		 397 aa  213  7e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 		 408 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 		 404 aa  192  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  33.57 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 		 410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 		 408 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 		 423 aa  153  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  29.05 
 
 		 429 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 517 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  29.45 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.21 
 
 		 413 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  26.21 
 
 		 413 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.21 
 
 		 413 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 441 aa  133  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 413 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 		 405 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  28.44 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.88 
 
 		 409 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  23.99 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  26.97 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 415 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  28.96 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  25.18 
 
 		 450 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  25.06 
 
 		 411 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.95 
 
 		 404 aa  93.2  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  23.51 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  28.53 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  28.53 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  28.53 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  28.53 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  28.53 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  23.89 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  27.34 
 
 		 407 aa  90.1  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  27.42 
 
 		 407 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 407 aa  89.7  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  27.34 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1607  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0834278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  27.34 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  27.08 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  27.08 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 		 409 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  21.35 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  24.21 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  27.02 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  26.82 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  27.04 
 
 		 435 aa  86.7  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0146  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0151  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  26.75 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  26.29 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  26.68 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  26.1 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  27.18 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  25.94 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  24.13 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4749  glycosyl transferase group 1  27.58 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000897702  normal  0.0900271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  23.41 
 
 		 475 aa  76.6  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  26.18 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  23.28 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>