More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0824 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  100 
 
 
450 aa  908    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  86.67 
 
 
450 aa  777    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  69.8 
 
 
435 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  60 
 
 
433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  52.93 
 
 
410 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  50.62 
 
 
411 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  53.9 
 
 
421 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  53.69 
 
 
420 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  50.49 
 
 
415 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  45.28 
 
 
407 aa  336  5.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  45.12 
 
 
407 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  45.12 
 
 
407 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  45.12 
 
 
407 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  45.12 
 
 
407 aa  329  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  44.9 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  44.88 
 
 
407 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  44.66 
 
 
407 aa  318  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  44.66 
 
 
407 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  44.66 
 
 
407 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  44.66 
 
 
407 aa  317  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  44.42 
 
 
407 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  44.42 
 
 
407 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1607  glycosyl transferase group 1  44.66 
 
 
407 aa  315  8e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0834278  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  44.72 
 
 
431 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  38.29 
 
 
406 aa  272  7e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 
415 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
412 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 
423 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
427 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
421 aa  227  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  35.56 
 
 
429 aa  224  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
406 aa  206  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  34.79 
 
 
425 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 
418 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
409 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
409 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
423 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
408 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  29.2 
 
 
413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02950  Glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.89718  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  26.12 
 
 
407 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
411 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
410 aa  123  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1819  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
439 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00811272  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
412 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.25 
 
 
404 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
403 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
411 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
404 aa  102  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
419 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
442 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
423 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  25.64 
 
 
417 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 
566 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
457 aa  100  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  24.38 
 
 
416 aa  97.8  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
418 aa  93.6  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  30.02 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
401 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
416 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
409 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
416 aa  86.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 
415 aa  84  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.49 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.49 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  22.49 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  26.2 
 
 
475 aa  79.7  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  20.56 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.56 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 
413 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2386  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  22.35 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  21.62 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  26.97 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  23.39 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>