203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1012 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  98.28 
 
 		 407 aa  829    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1607  glycosyl transferase group 1  98.28 
 
 		 407 aa  827    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0834278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  86.49 
 
 		 407 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  86.49 
 
 		 407 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  86.49 
 
 		 407 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  98.77 
 
 		 407 aa  831    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  99.02 
 
 		 407 aa  834    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  98.28 
 
 		 407 aa  829    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  83.29 
 
 		 407 aa  710    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  98.28 
 
 		 407 aa  829    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 407 aa  840    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  86.49 
 
 		 407 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  98.77 
 
 		 407 aa  832    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  86.24 
 
 		 407 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  48.04 
 
 		 420 aa  335  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  43.51 
 
 		 410 aa  324  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  44.9 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  44.17 
 
 		 421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  43.58 
 
 		 450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  43.49 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  42.86 
 
 		 406 aa  296  6e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  41.56 
 
 		 411 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  44.51 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  41.35 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  40.68 
 
 		 415 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  37.11 
 
 		 412 aa  249  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  37.9 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 		 421 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  30.88 
 
 		 429 aa  173  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  34.01 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 		 418 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 408 aa  140  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  31.82 
 
 		 413 aa  135  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1819  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00811272  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  26.25 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02950  Glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.89718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  21.55 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  25 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  26.03 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 411 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  23 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.59 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  22.59 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.59 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2386  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25.98 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  33.57 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  20.18 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  25.1 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 		 566 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  22.47 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0146  glycosyl transferase, group 1  23.04 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0151  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1493  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1282  glycosyltransferase-like protein  21.63 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.48 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>