236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0746 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 422 aa  857    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  48.41 
 
 		 411 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  45.54 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  42.32 
 
 		 416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  42.61 
 
 		 414 aa  308  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  40.1 
 
 		 417 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  38.77 
 
 		 419 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  35.38 
 
 		 397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 		 408 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 		 410 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  30.58 
 
 		 413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 517 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 412 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 		 412 aa  152  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  27.1 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 		 427 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  28.29 
 
 		 429 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 402 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 		 413 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 424 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 424 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.59 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.59 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  25.59 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 415 aa  119  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  24.81 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  24.29 
 
 		 411 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 421 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  23.59 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  29.23 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  26.03 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  31.43 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  24.24 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 415 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.54 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 		 412 aa  96.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 425 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0146  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0151  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 418 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  22.06 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 		 423 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 422 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  25.72 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  28.82 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  23.46 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  23.22 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  25.37 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25.73 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1282  glycosyltransferase-like protein  22.28 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20940  glycosyltransferase  26.09 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  22.71 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  24.88 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  22.01 
 
 		 566 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2386  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1493  glycosyl transferase group 1  22.46 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4749  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000897702  normal  0.0900271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  22.65 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  29.52 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  24.09 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  24.64 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  28.02 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  19.86 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08730  glycosyltransferase  25.45 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510164  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02950  Glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.89718  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  22.66 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>