141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1113 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
400 aa  821    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0792  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
399 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.416249  hitchhiker  0.00203694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  25.9 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  26.48 
 
 
411 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4749  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
407 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000897702  normal  0.0900271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0146  glycosyl transferase, group 1  23.99 
 
 
401 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0151  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
401 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 
442 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 
421 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
423 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  22.53 
 
 
416 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  22.93 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 
566 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  22.43 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 
413 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 
421 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  22.14 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  20.68 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  22.66 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 
423 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  21.8 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 
427 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  21.37 
 
 
475 aa  79  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  22.93 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  21.19 
 
 
517 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  23.56 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  24.35 
 
 
407 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  24.35 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  24.35 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  24.35 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  24.35 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  21.63 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  21.47 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.76 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.76 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  23.76 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  21.61 
 
 
424 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  21.61 
 
 
424 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  21.61 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  21.36 
 
 
361 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1493  glycosyl transferase group 1  20.3 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  21.47 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  21.53 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  19.94 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  21.84 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  22.09 
 
 
407 aa  67  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  20.5 
 
 
411 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  21.01 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  22.15 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  22.07 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  18.47 
 
 
422 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  23.46 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  20.98 
 
 
436 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  22.08 
 
 
416 aa  64.7  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  22.99 
 
 
407 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  21.91 
 
 
416 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 
412 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2386  glycosyl transferase, group 1  19.4 
 
 
399 aa  63.5  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  19.73 
 
 
419 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.32 
 
 
409 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  22.07 
 
 
390 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  26.24 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  21.91 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  21.14 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  25.55 
 
 
407 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  25.55 
 
 
407 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  21.43 
 
 
397 aa  60.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  25.55 
 
 
407 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  23.1 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  20.84 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  25.95 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  24.82 
 
 
407 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1607  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0834278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  24.82 
 
 
407 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0666  hypothetical protein  24.07 
 
 
399 aa  57.8  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.202618  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  21.25 
 
 
403 aa  57.4  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  23.31 
 
 
421 aa  57.4  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
402 aa  57.4  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
418 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
425 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  20.9 
 
 
405 aa  56.6  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
417 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 
414 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.16 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  23.1 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  20.11 
 
 
401 aa  54.3  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  22.43 
 
 
433 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 
404 aa  53.5  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
434 aa  53.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>