119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0792 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0792  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
399 aa  828    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.416249  hitchhiker  0.00203694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  32.49 
 
 
396 aa  226  8e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
400 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 
409 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
409 aa  100  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
421 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  22.17 
 
 
427 aa  92.8  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  23.68 
 
 
429 aa  93.2  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 
423 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 
420 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0146  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 
401 aa  86.7  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0151  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 
401 aa  86.7  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  22.71 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4749  glycosyl transferase group 1  20.86 
 
 
407 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000897702  normal  0.0900271 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  23.33 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  22.13 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.64 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  21.89 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.21 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  22.49 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  25.21 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
566 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  22.85 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  21.12 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  22.39 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  23.17 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  20.14 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
422 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  21.61 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  21.67 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  23.13 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  23.74 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  22.36 
 
 
450 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
415 aa  63.5  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  19.01 
 
 
361 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  21.32 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  21.87 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  21.31 
 
 
422 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  21.3 
 
 
435 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  21.43 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  22.14 
 
 
517 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  21.3 
 
 
418 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  21.3 
 
 
425 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2386  glycosyl transferase, group 1  22.07 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  23.75 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  20.91 
 
 
450 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  23.33 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  20.32 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  21.17 
 
 
411 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  21.36 
 
 
407 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  21.23 
 
 
416 aa  57.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  22.85 
 
 
395 aa  56.6  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  21.96 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  22.06 
 
 
406 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  22.25 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1819  glycosyl transferase group 1  21.71 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00811272  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  23.26 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1493  glycosyl transferase group 1  18.54 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  20.59 
 
 
407 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  20.93 
 
 
407 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  21.48 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  20.93 
 
 
407 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  20.93 
 
 
407 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  20.59 
 
 
407 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1607  glycosyl transferase group 1  22.29 
 
 
407 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0834278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
416 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  22.29 
 
 
407 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  22.97 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  22.67 
 
 
405 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  22.29 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  22.97 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  22.05 
 
 
408 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  21.99 
 
 
407 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
392 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1282  glycosyltransferase-like protein  24.4 
 
 
408 aa  50.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  19.82 
 
 
416 aa  50.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  21.31 
 
 
421 aa  50.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 
397 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>