100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1384 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  100 
 
 		 408 aa  840    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  49.86 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  46.33 
 
 		 391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  37.28 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 517 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 		 413 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.75 
 
 		 409 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  23.39 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.63 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  23.63 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.63 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  22.01 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  23.83 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  23.22 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  21.98 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  23.05 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  23.19 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  21.73 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  22.14 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  24.4 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  24.57 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  22.97 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  25 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  24.27 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  21.08 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  20.93 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  22.25 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  22.35 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  21.32 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 		 421 aa  57  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  23.49 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  29.86 
 
 		 430 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  22.49 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  21.65 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 431 aa  53.5  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  21.35 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  19.85 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  30.95 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  22.82 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0792  glycosyl transferase, group 1  22.05 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.416249  hitchhiker  0.00203694 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  26.55 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02950  Glycosyl transferase, group 1  23.18 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.89718  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  26.61 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  22.45 
 
 		 443 aa  49.7  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  23.58 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  24.68 
 
 		 452 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  25.66 
 
 		 421 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  23.74 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 408 aa  46.6  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  20.32 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  22.69 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  24.6 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  25 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4749  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000897702  normal  0.0900271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 425 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 		 402 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  22.71 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 457 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  23.4 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 405 aa  43.5  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>