51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1958 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  853    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  48.8 
 
 		 437 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  43 
 
 		 416 aa  356  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  27.06 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  28.64 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  28.92 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  23.71 
 
 		 567 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  23.71 
 
 		 567 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  27.6 
 
 		 430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  22.2 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  27.83 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  27.43 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  23.57 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  23.15 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  27.73 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  26.33 
 
 		 333 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  22.83 
 
 		 428 aa  97.1  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  25 
 
 		 396 aa  96.7  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  28.74 
 
 		 464 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  27.55 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  24.81 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  25.32 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0884  hypothetical protein  26.6 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  24.33 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  27.4 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  20.71 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  26.81 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  22.7 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  28.31 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  23.97 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  21.71 
 
 		 522 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  26.55 
 
 		 463 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  24.15 
 
 		 463 aa  50.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3132  hypothetical protein  23.94 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.290688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.7 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2428  hypothetical protein  21.77 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0174  hypothetical protein  21.18 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000353751  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  21.73 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 468 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 418 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  25.21 
 
 		 603 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  23.4 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 382 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>