26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0884 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0884  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  862    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  25 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  26.6 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  24.44 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  26.69 
 
 
464 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  24.92 
 
 
405 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
420 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  23.91 
 
 
437 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  24.56 
 
 
429 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  28.35 
 
 
463 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  24.66 
 
 
423 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  26.19 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  23.88 
 
 
398 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  23.08 
 
 
431 aa  60.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
429 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  25.07 
 
 
452 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
403 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 
415 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  22.72 
 
 
424 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 
414 aa  47  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  26.24 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  19.35 
 
 
567 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  19.35 
 
 
567 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  24.57 
 
 
441 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>