55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0788 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  72.98 
 
 
452 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  91.02 
 
 
405 aa  731    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  933    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  61.06 
 
 
429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  32.33 
 
 
433 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
443 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
429 aa  153  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  28.8 
 
 
423 aa  147  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  30.55 
 
 
441 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  31.8 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  31.29 
 
 
430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  31.6 
 
 
454 aa  132  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  30.47 
 
 
430 aa  129  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  32.15 
 
 
442 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  26.38 
 
 
567 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  26.38 
 
 
567 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  27.04 
 
 
415 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
427 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  26.36 
 
 
522 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  23.96 
 
 
431 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  29.87 
 
 
419 aa  94.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  29.68 
 
 
388 aa  93.6  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  23.26 
 
 
434 aa  91.3  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  24.44 
 
 
416 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  25.11 
 
 
437 aa  86.7  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  23.05 
 
 
463 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  27.2 
 
 
463 aa  70.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  27.19 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4581  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0884  hypothetical protein  26.69 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  29.35 
 
 
364 aa  63.2  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  22.41 
 
 
403 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  22.99 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
416 aa  57.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3508  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
379 aa  57  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8743499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  28.62 
 
 
428 aa  55.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
517 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  19.85 
 
 
431 aa  53.9  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  21.94 
 
 
414 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  22.81 
 
 
333 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
412 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.06 
 
 
415 aa  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  20.07 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2739  hypothetical protein  30.51 
 
 
820 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
374 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
407 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  20.74 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  24.83 
 
 
443 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
441 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  25.17 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 
408 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  22.71 
 
 
440 aa  43.9  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>