46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0567 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
434 aa  873    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  27.66 
 
 
423 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  26.05 
 
 
431 aa  95.9  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  26.76 
 
 
430 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  23.26 
 
 
464 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  21.45 
 
 
452 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  26.29 
 
 
429 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  24.73 
 
 
433 aa  88.2  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  24.07 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  23.67 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  28.9 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  23.97 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  28.06 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  22.44 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  23.1 
 
 
454 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  26.43 
 
 
567 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  26.43 
 
 
567 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  24.88 
 
 
430 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
443 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  22.83 
 
 
333 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  27.18 
 
 
431 aa  60.1  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  20.06 
 
 
416 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  21.09 
 
 
429 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4581  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 
416 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
406 aa  53.1  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3508  glycosyl transferase group 1  22.18 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8743499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  22.98 
 
 
428 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
386 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  22.94 
 
 
428 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  23.5 
 
 
463 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  21.2 
 
 
382 aa  47.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.01 
 
 
394 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  19.74 
 
 
422 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
398 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
381 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  22.53 
 
 
522 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 
404 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  21.31 
 
 
388 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
407 aa  43.1  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  21.24 
 
 
443 aa  43.1  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>