56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3262 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  895    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  41.5 
 
 
430 aa  331  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  42.4 
 
 
398 aa  320  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  37.87 
 
 
423 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  31.71 
 
 
441 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  34.99 
 
 
429 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  34.56 
 
 
452 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  32.33 
 
 
464 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  34.32 
 
 
405 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  27.83 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  27.8 
 
 
430 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  24.62 
 
 
454 aa  108  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  24.3 
 
 
463 aa  98.2  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  25.37 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  23.73 
 
 
567 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  23.73 
 
 
567 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  22.43 
 
 
431 aa  93.6  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 
429 aa  93.2  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  24.01 
 
 
522 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  24.73 
 
 
434 aa  88.2  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  22.44 
 
 
428 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  22.68 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  24.74 
 
 
428 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  25.15 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  26.81 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  22.3 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  24.12 
 
 
463 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 
517 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 
416 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  23.71 
 
 
333 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  24.21 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  22.4 
 
 
407 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  22.12 
 
 
441 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  28.68 
 
 
370 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.6 
 
 
409 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  20.53 
 
 
431 aa  51.2  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  23.19 
 
 
368 aa  50.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
522 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 
420 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4581  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
416 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  21.22 
 
 
437 aa  47  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  43.59 
 
 
421 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  23.33 
 
 
405 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  20.08 
 
 
404 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  22.15 
 
 
400 aa  43.5  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  23.05 
 
 
430 aa  43.5  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
380 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 
375 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
408 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>