36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5011 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  815    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  26.27 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  25.51 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  23.22 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  24.48 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  21.98 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  24.82 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  24.41 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  22.3 
 
 		 452 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  24.43 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  24.41 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  21.1 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  21.91 
 
 		 567 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  24.4 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  21.91 
 
 		 567 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  22.47 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  22.99 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  23.32 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  21.3 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  23.85 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  22.07 
 
 		 522 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  21.7 
 
 		 443 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  21.72 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  24.72 
 
 		 431 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  21.25 
 
 		 388 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  23.12 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 416 aa  49.7  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3132  hypothetical protein  23.81 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.290688 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  22.33 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  21.87 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  24.35 
 
 		 463 aa  43.1  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 		 390 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>