145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1322 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
429 aa  859    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  35.32 
 
 
442 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  31.64 
 
 
415 aa  219  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  38.98 
 
 
443 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  32.26 
 
 
430 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  31.18 
 
 
454 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  27.6 
 
 
567 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  27.6 
 
 
567 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  31.5 
 
 
522 aa  169  7e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  32.79 
 
 
416 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
427 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  31.46 
 
 
464 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  32.57 
 
 
429 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  31.16 
 
 
419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  31 
 
 
452 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  25.12 
 
 
431 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  30.63 
 
 
437 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  33.74 
 
 
405 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
424 aa  129  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  28.61 
 
 
388 aa  126  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  24.89 
 
 
423 aa  114  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2302  hypothetical protein  24.88 
 
 
399 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000101435  decreased coverage  0.00084282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  25.45 
 
 
441 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  24.67 
 
 
433 aa  93.2  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  25.89 
 
 
398 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2071  hypothetical protein  22.49 
 
 
463 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113923  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  23.83 
 
 
430 aa  86.3  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  26.6 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  24.84 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  24.55 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  25.25 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  20.6 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
517 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  19.9 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
403 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3132  hypothetical protein  28.04 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.290688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4581  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  28.84 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  21.01 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
413 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
392 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0174  hypothetical protein  22.05 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000353751  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
419 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  22.46 
 
 
451 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  24.05 
 
 
440 aa  64.3  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  22.03 
 
 
403 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
405 aa  63.2  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
418 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  24.17 
 
 
370 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
445 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  22.22 
 
 
407 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  22.02 
 
 
407 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0884  hypothetical protein  24.27 
 
 
416 aa  60.5  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
442 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
371 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  21.09 
 
 
434 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  23.09 
 
 
402 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  19.82 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
481 aa  57.4  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  21.3 
 
 
375 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 
412 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  27.84 
 
 
428 aa  56.6  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
420 aa  56.6  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2235  hypothetical protein  22.36 
 
 
426 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.54794  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  20.24 
 
 
431 aa  54.7  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  22.06 
 
 
535 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  17.48 
 
 
409 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  21.49 
 
 
463 aa  53.5  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
435 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
409 aa  53.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  23.37 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.08 
 
 
394 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  25.88 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2429  hypothetical protein  27.49 
 
 
444 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  23.7 
 
 
385 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.45 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.45 
 
 
413 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  19.45 
 
 
413 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
411 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  19.18 
 
 
416 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  26.7 
 
 
406 aa  49.7  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
389 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
359 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
476 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
416 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  21.35 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>