15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2302 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2302  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  822    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000101435  decreased coverage  0.00084282 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2071  hypothetical protein  34.07 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0174  hypothetical protein  30.77 
 
 		 444 aa  172  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000353751  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2429  hypothetical protein  26.65 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2235  hypothetical protein  30.29 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.54794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  20.44 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  23.03 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  20.33 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  22.34 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  24.23 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  26.01 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  20 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  21.12 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  18.33 
 
 		 522 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>