92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4436 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 442 aa  891    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  69.86 
 
 		 430 aa  619  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  27.41 
 
 		 567 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  27.41 
 
 		 567 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  28.44 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  30.09 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 		 427 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 		 424 aa  144  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  27.61 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  30.02 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  23.27 
 
 		 431 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  31 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  32.15 
 
 		 464 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  29.27 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  27.83 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  23.97 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  29.06 
 
 		 437 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  33.8 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  23.42 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  26.81 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  25.95 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  27.41 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  25.5 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  23.76 
 
 		 522 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  26.06 
 
 		 441 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  26.38 
 
 		 440 aa  89  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  25.68 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  25.64 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4581  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  23.45 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  26.95 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  22.44 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  20.27 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  23.81 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  20.45 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  25.18 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  22.33 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  23.9 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2302  hypothetical protein  20.33 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000101435  decreased coverage  0.00084282 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2071  hypothetical protein  19.1 
 
 		 463 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 		 403 aa  50.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  21.22 
 
 		 431 aa  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  23.44 
 
 		 451 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.44 
 
 		 394 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  24.53 
 
 		 370 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 517 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  21.55 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  25.7 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0791  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 		 364 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  22.64 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  21.48 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0854  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0579816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  21.12 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  25.55 
 
 		 557 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  36.26 
 
 		 453 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  21.7 
 
 		 566 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 394 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  22.88 
 
 		 395 aa  46.6  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  20.16 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  24.6 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  23.62 
 
 		 403 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 		 390 aa  44.3  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 391 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2428  hypothetical protein  21.29 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 		 418 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>