68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4434 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  72.98 
 
 		 464 aa  642    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  909    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  72.41 
 
 		 405 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  60.19 
 
 		 429 aa  490  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  34.56 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  30.05 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 443 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  28.92 
 
 		 398 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  28.71 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  31.57 
 
 		 430 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  30.27 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  30.75 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  31 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  23.18 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  29.23 
 
 		 415 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  27.43 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  24.48 
 
 		 567 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  24.48 
 
 		 567 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  27.54 
 
 		 388 aa  99.8  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  26.61 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  27.37 
 
 		 437 aa  91.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  21.45 
 
 		 434 aa  90.1  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  24.64 
 
 		 522 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  28.45 
 
 		 405 aa  83.2  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  21.82 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  22.06 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  26.56 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4581  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  23.21 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  29.07 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  22.3 
 
 		 396 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  25.9 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  24.1 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0884  hypothetical protein  25.07 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3508  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8743499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  26 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  30.3 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  18.51 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  22.14 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  30.11 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2739  hypothetical protein  30.14 
 
 		 820 aa  53.9  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 400 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2302  hypothetical protein  24.23 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000101435  decreased coverage  0.00084282 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.18 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  18.54 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  24.68 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  24.67 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2428  hypothetical protein  21.19 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 403 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 408 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 		 398 aa  43.5  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 		 391 aa  43.1  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>