37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2124 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  854    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  98.13 
 
 		 428 aa  837    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  23.97 
 
 		 442 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  22.46 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  25.5 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  25 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  23.72 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  23.21 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  20.82 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  22.06 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  22.44 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  20.6 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  21.09 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  22.77 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  25.19 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  24.41 
 
 		 396 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  22.51 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  21.19 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  21.86 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  21.86 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  18.54 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  23.64 
 
 		 333 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  19.57 
 
 		 443 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  22.98 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  20.53 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  19.56 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  25.79 
 
 		 463 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  22.26 
 
 		 451 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  23.59 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  24.36 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  23.59 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  21 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  22.04 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 399 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>