27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0247 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  914    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  76.99 
 
 		 440 aa  716    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  30.26 
 
 		 333 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  24.83 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  27.41 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  21.88 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  25.91 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  25 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  26.71 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  22.79 
 
 		 567 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  22.79 
 
 		 567 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  21.65 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  23.02 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  22.94 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  25.51 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  24.19 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  21.79 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  22.45 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  24.36 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  22.95 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  24.83 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  23.87 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  26.67 
 
 		 431 aa  43.1  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  23.96 
 
 		 405 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  21.24 
 
 		 434 aa  43.1  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  22.59 
 
 		 386 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>