56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08846 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  100 
 
 
431 aa  883    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  56.34 
 
 
427 aa  495  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  52.8 
 
 
424 aa  459  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
443 aa  233  6e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  30.8 
 
 
415 aa  190  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  27.25 
 
 
567 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  27.25 
 
 
567 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
429 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  23.27 
 
 
442 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  25.06 
 
 
430 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  24.19 
 
 
430 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  25.93 
 
 
454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  25.73 
 
 
522 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  23.18 
 
 
452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  23.96 
 
 
464 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  23.53 
 
 
416 aa  106  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  24.21 
 
 
405 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  24.93 
 
 
419 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  21.5 
 
 
429 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  26.05 
 
 
434 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  23.67 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  23.06 
 
 
441 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  27.69 
 
 
423 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  22.43 
 
 
433 aa  93.6  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  22.66 
 
 
437 aa  93.6  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  25.23 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  25.15 
 
 
463 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  21.97 
 
 
463 aa  66.6  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  22.51 
 
 
428 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  23.57 
 
 
431 aa  63.2  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  22.51 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  22.94 
 
 
443 aa  60.8  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0884  hypothetical protein  23.08 
 
 
416 aa  60.5  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  20.42 
 
 
333 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3132  hypothetical protein  20.85 
 
 
490 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.290688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  21.04 
 
 
403 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  22.59 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.47 
 
 
413 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  20.05 
 
 
440 aa  53.5  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  20.56 
 
 
416 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  24.23 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24.66 
 
 
376 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
395 aa  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  22.19 
 
 
413 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.19 
 
 
413 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 
395 aa  50.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 
380 aa  47  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
394 aa  46.6  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  21.14 
 
 
420 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1187  glycosyl transferase group 1  20.1 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  21.1 
 
 
395 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  18.45 
 
 
403 aa  44.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  20.5 
 
 
413 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>