95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0790 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
430 aa  871    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  69.86 
 
 
442 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
429 aa  202  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  27.15 
 
 
567 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  27.15 
 
 
567 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  29.07 
 
 
415 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
427 aa  146  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
443 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
424 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  31.29 
 
 
464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  31.7 
 
 
429 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  26.65 
 
 
416 aa  130  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  30.75 
 
 
452 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  24.19 
 
 
431 aa  123  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  28.35 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  35.46 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  27.06 
 
 
423 aa  112  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  27.8 
 
 
433 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  28.88 
 
 
388 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  27.75 
 
 
419 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  24.83 
 
 
443 aa  101  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  25.68 
 
 
522 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  27.7 
 
 
430 aa  99.8  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  25 
 
 
428 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  24.63 
 
 
428 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  27.45 
 
 
437 aa  95.5  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  24.68 
 
 
396 aa  94.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  29.64 
 
 
405 aa  92.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  28.83 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  24.84 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  23.06 
 
 
440 aa  79.7  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  25.96 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  24.12 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  24.78 
 
 
451 aa  67  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  24.88 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
412 aa  63.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  21.64 
 
 
375 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  22.26 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4581  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
416 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  20.87 
 
 
431 aa  60.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  22.97 
 
 
402 aa  60.1  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
426 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  24.32 
 
 
407 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
517 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  29.14 
 
 
428 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
403 aa  57  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  25.98 
 
 
417 aa  57  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  20.82 
 
 
369 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  22.39 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  29.86 
 
 
408 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  26.85 
 
 
390 aa  53.5  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 
415 aa  53.5  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  21.69 
 
 
463 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
421 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 
407 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.79 
 
 
409 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 
385 aa  50.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
396 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
404 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3508  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
379 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8743499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  26.55 
 
 
413 aa  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 
427 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2739  hypothetical protein  29.01 
 
 
820 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  23.04 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26 
 
 
394 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  18.51 
 
 
404 aa  47  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  25.34 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
441 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
381 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3712  hypothetical protein  26.77 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0151792  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  22.98 
 
 
398 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  20.36 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
366 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  29.19 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  20.49 
 
 
386 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
346 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  21.92 
 
 
421 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  35.44 
 
 
360 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  27.06 
 
 
370 aa  43.5  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
419 aa  43.5  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
405 aa  43.1  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 
412 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>