More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4035 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
421 aa  862    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
420 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
403 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
407 aa  232  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
412 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  33.98 
 
 
417 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
412 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
415 aa  173  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
517 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  29.3 
 
 
407 aa  170  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 
408 aa  169  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
408 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
441 aa  166  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
411 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  28.74 
 
 
390 aa  159  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
414 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
436 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
404 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  30.67 
 
 
413 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
427 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.55 
 
 
413 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  25.55 
 
 
413 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.55 
 
 
413 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
407 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 
413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.24 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  28.8 
 
 
417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
419 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
403 aa  126  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
408 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  25.77 
 
 
415 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
442 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 
402 aa  122  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  23.39 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
423 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  26.47 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  25.06 
 
 
429 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
416 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
424 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
424 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  23.39 
 
 
475 aa  109  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 
566 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
412 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
409 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
405 aa  106  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 
422 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
409 aa  106  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  22.84 
 
 
404 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
398 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
457 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
431 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
423 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  24.57 
 
 
397 aa  95.5  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  27.79 
 
 
398 aa  93.2  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.64 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  26.16 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
418 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  29.97 
 
 
394 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
400 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  23.47 
 
 
411 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
418 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
415 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
411 aa  88.2  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
405 aa  87  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
405 aa  87  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  28.87 
 
 
416 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  28.27 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  28.27 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  28.27 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  28.27 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.24 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  24.55 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  24.4 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  28.27 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 
400 aa  82  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  24.21 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0792  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.416249  hitchhiker  0.00203694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  24.32 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
427 aa  76.3  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  27.38 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>