More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2277 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 412 aa  856    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  60.19 
 
 		 415 aa  531  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  37.38 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  37.25 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  38.41 
 
 		 421 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  37.59 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  37.59 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  37.59 
 
 		 407 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  37.59 
 
 		 407 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 		 411 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  37.59 
 
 		 407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  37.35 
 
 		 407 aa  256  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  37.11 
 
 		 407 aa  249  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  36.96 
 
 		 407 aa  249  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  36.87 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  36.96 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  35.12 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  36.96 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  36.96 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  36.71 
 
 		 407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  34.79 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1607  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0834278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  35.34 
 
 		 410 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  36.15 
 
 		 431 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  35.46 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  34.56 
 
 		 420 aa  222  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  33.18 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 		 406 aa  195  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 423 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  28.33 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 427 aa  160  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 408 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 418 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02950  Glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.89718  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  28.24 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  25.87 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 409 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 410 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  25.42 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 416 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  23.06 
 
 		 412 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 		 405 aa  106  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 		 361 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  27.07 
 
 		 397 aa  99.8  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 566 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 		 422 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 407 aa  96.3  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1819  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 439 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00811272  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.75 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.75 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  21.75 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 		 423 aa  93.2  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25.25 
 
 		 404 aa  89  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  23.83 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  25.35 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  22.57 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  26.28 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.83 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  20.26 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  22.84 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  22.41 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  22.56 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  22.9 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  22.15 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>