136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2748 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
402 aa  799    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  40.2 
 
 
404 aa  248  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 
423 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 
401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  32.19 
 
 
416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  36.24 
 
 
422 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
457 aa  142  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  26.58 
 
 
475 aa  140  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 
409 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4749  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
407 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000897702  normal  0.0900271 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
566 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
408 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
427 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
421 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0146  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0151  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  26.84 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  28.57 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
427 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
420 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  23.03 
 
 
411 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
424 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
424 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  28.15 
 
 
410 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
409 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
403 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  25.64 
 
 
406 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  21.87 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  35.33 
 
 
407 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  35.33 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  35.33 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  26.29 
 
 
407 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  35.33 
 
 
407 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  35.33 
 
 
407 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1282  glycosyltransferase-like protein  23.33 
 
 
408 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
431 aa  94  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
412 aa  94  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
405 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
410 aa  94  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
419 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2386  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  26.48 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  26.48 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  26.22 
 
 
407 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  26.22 
 
 
407 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  26.22 
 
 
407 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  32.08 
 
 
407 aa  90.9  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  26.22 
 
 
407 aa  90.5  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
436 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.01 
 
 
413 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1607  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
407 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0834278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
411 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
421 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
418 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  20.35 
 
 
406 aa  88.2  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
414 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
422 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
361 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  20.48 
 
 
423 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  26.86 
 
 
420 aa  86.3  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  23.98 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  18.58 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.12 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
517 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.12 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  20.12 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  18.59 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1493  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  21.61 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  24.11 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.25 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  34.55 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  25.48 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  27.11 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  27.45 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  27.78 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  20.19 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  20.74 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
418 aa  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0792  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
399 aa  60.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.416249  hitchhiker  0.00203694 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>