More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3178 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 415 aa  833    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  50.61 
 
 		 411 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  50.25 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  51.82 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  49.51 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  48.93 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  51.1 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  52.69 
 
 		 435 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  52.14 
 
 		 421 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  43 
 
 		 407 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  43.73 
 
 		 431 aa  279  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  42.75 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  42.75 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  42.75 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  42.75 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  40.44 
 
 		 407 aa  262  8e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  40.29 
 
 		 407 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  40.48 
 
 		 407 aa  256  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  39.81 
 
 		 407 aa  255  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  39.81 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  39.81 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1607  glycosyl transferase group 1  39.81 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0834278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  39.81 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  39.56 
 
 		 407 aa  254  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  32.69 
 
 		 406 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 		 423 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 406 aa  195  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 424 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 424 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  32.71 
 
 		 429 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 		 427 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 409 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 427 aa  153  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02950  Glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 333 aa  140  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.89718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 		 423 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 517 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 441 aa  116  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  27.34 
 
 		 413 aa  116  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 404 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 		 411 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 		 419 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  24.51 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1819  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00811272  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 442 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 		 416 aa  93.6  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.78 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  27.19 
 
 		 416 aa  87  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  25.06 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  21.2 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  22.14 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2386  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  17.34 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.29 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  29.73 
 
 		 475 aa  69.7  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  21.29 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.79 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1493  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  17.34 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.13 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  27.2 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  29.25 
 
 		 569 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 871 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  20 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>