144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2386 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2386  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
399 aa  805    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4749  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
407 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000897702  normal  0.0900271 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
422 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
409 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  25.06 
 
 
475 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
442 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
361 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  22.08 
 
 
411 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
423 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.25 
 
 
404 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  27.56 
 
 
429 aa  106  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
401 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  23.84 
 
 
416 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 
408 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1282  glycosyltransferase-like protein  22.33 
 
 
408 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
427 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  28.8 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
420 aa  92.8  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  28 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  27.69 
 
 
407 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0146  glycosyl transferase, group 1  22.47 
 
 
401 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0151  glycosyl transferase group 1  22.47 
 
 
401 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  27.69 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  27.69 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  27.38 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
517 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 
403 aa  84  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  26.5 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  21.6 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  27.8 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.28 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.28 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  22.28 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  26.25 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  26.71 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  25.59 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  29.08 
 
 
450 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  27.3 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1493  glycosyl transferase group 1  21.91 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  27.6 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  27.6 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  27.38 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  27 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  27 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1607  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
407 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0834278  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  18.84 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  23.77 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  19.79 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  24.83 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  26.91 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  25.38 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  27.19 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
425 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 
411 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
407 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  23.36 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  25.41 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  21.39 
 
 
418 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
436 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  19.4 
 
 
400 aa  63.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 
415 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  22.41 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  21.34 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  21.13 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  20.12 
 
 
395 aa  60.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0792  glycosyl transferase, group 1  22.07 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.416249  hitchhiker  0.00203694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 
423 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1819  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
439 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00811272  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
405 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
418 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  29.71 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0492  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
410 aa  53.5  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
395 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>