More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1076 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  100 
 
 
433 aa  885    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  60 
 
 
450 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  61.04 
 
 
450 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  55.83 
 
 
411 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  58.31 
 
 
435 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  50.98 
 
 
421 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  52.39 
 
 
420 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  51.03 
 
 
410 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  49.51 
 
 
415 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  45.41 
 
 
431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  43.84 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  44.12 
 
 
407 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  44.12 
 
 
407 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  44.12 
 
 
407 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  43.87 
 
 
407 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  43.49 
 
 
407 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  43.63 
 
 
407 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  43.49 
 
 
407 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  43.49 
 
 
407 aa  288  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  43.49 
 
 
407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1607  glycosyl transferase group 1  43.49 
 
 
407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0834278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  43.49 
 
 
407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  43.49 
 
 
407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  43.49 
 
 
407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 
412 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  37.56 
 
 
406 aa  267  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 
415 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 
406 aa  235  9e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  36.61 
 
 
423 aa  230  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
421 aa  227  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 
427 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  34.55 
 
 
429 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 
424 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 
424 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 
425 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
409 aa  171  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
418 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02950  Glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
333 aa  155  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.89718  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
427 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
408 aa  137  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  29.56 
 
 
413 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1819  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
439 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00811272  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
517 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
422 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
408 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
412 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
441 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
416 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  26.57 
 
 
417 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
418 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 
403 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
419 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  25.44 
 
 
416 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
411 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
423 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
416 aa  100  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
410 aa  100  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  25.92 
 
 
405 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
415 aa  96.7  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
442 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
361 aa  93.2  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
407 aa  90.9  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
408 aa  90.5  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
414 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  23.33 
 
 
388 aa  88.2  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  23.46 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 
422 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25.67 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  20.92 
 
 
403 aa  84  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2386  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  22.95 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.51 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.51 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  23.51 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  21.22 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  22.38 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
566 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
406 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
405 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.61 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.18 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>