More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5252 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
436 aa  894    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  38.2 
 
 
405 aa  246  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 
407 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  37.91 
 
 
417 aa  233  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  35 
 
 
390 aa  210  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
420 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
412 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
517 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
408 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
403 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
441 aa  132  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
408 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  27.23 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  28.88 
 
 
413 aa  120  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  27.79 
 
 
411 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  24.25 
 
 
427 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  26.16 
 
 
407 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
423 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
416 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 
421 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  25.74 
 
 
429 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
409 aa  104  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  22.25 
 
 
408 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 
413 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
412 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 
404 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.55 
 
 
413 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  22.55 
 
 
413 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.55 
 
 
413 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
416 aa  90.9  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.72 
 
 
409 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  20.76 
 
 
421 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 
402 aa  87  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
405 aa  86.7  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 
406 aa  84  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.55 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
402 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
566 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
414 aa  77  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  21.67 
 
 
404 aa  77  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  26.2 
 
 
475 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
768 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
405 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
404 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  29.1 
 
 
569 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  25 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  22.86 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  24.89 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  20.96 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  21.9 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  23.57 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  23.9 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  28.46 
 
 
557 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  21.2 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  21.5 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  24.4 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
422 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  24.4 
 
 
407 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3712  hypothetical protein  26.12 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0151792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  23.74 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>