228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1168 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  100 
 
 
404 aa  799    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  43.95 
 
 
423 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  46.5 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  44.53 
 
 
416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  47.12 
 
 
422 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  39.15 
 
 
402 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
442 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
566 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  30.63 
 
 
475 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 
457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4749  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
407 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000897702  normal  0.0900271 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  24.2 
 
 
411 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  28.64 
 
 
429 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
423 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
408 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
361 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
427 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
409 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
424 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
420 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
424 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
408 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0146  glycosyl transferase, group 1  22.33 
 
 
401 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0151  glycosyl transferase group 1  22.33 
 
 
401 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  24.67 
 
 
407 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1282  glycosyltransferase-like protein  24.25 
 
 
408 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  29.59 
 
 
413 aa  116  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  27.51 
 
 
417 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  28.54 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  29.98 
 
 
427 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
441 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
415 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  28.94 
 
 
421 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2386  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
399 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  25.55 
 
 
397 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  28.25 
 
 
450 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
403 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
517 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
419 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  27.32 
 
 
406 aa  102  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  32.12 
 
 
417 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
407 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  28.4 
 
 
420 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
410 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
416 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  27.34 
 
 
450 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
423 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  29.77 
 
 
407 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
411 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  29.77 
 
 
407 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  29.77 
 
 
407 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  29.45 
 
 
407 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
415 aa  89.7  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  29.13 
 
 
407 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
412 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
425 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
418 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  25.67 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  21.05 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  26.78 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  28.49 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  25 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  22.5 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  21.34 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.28 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  20.37 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  21.28 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.28 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  25.98 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  27.49 
 
 
435 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  25.49 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  25.77 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  25.49 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  25.49 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  22 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  25.21 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  25.21 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  21.47 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>