More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3198 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 411 aa  833    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  55.83 
 
 		 433 aa  454  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  51.6 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  50.62 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  51.35 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  54.87 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  52.8 
 
 		 421 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  49.02 
 
 		 410 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  51.1 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  41.81 
 
 		 407 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  41.81 
 
 		 407 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  41.81 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  41.81 
 
 		 407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  41.56 
 
 		 407 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  41.56 
 
 		 407 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  39.95 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  41.08 
 
 		 407 aa  292  9e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  41.08 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  43.32 
 
 		 431 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  41.08 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  41.08 
 
 		 407 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1607  glycosyl transferase group 1  41.08 
 
 		 407 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0834278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  40.83 
 
 		 407 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  40.44 
 
 		 407 aa  289  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 		 412 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 		 415 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  35.35 
 
 		 406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 		 421 aa  209  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 		 427 aa  199  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  30.05 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 406 aa  189  9e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 424 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 424 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  29.61 
 
 		 413 aa  143  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 412 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 418 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02950  Glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.89718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 		 411 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 419 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  27.4 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  24.58 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  27 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  29.75 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  22.65 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1819  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 439 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00811272  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 403 aa  93.2  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 406 aa  90.1  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.03 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  22.03 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.03 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 871 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  23.96 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1493  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.08 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 816 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>