247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2612 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
408 aa  810    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  44.25 
 
 
425 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  44.47 
 
 
418 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1819  glycosyl transferase group 1  41.98 
 
 
439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00811272  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
423 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  31.4 
 
 
429 aa  180  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  33.66 
 
 
421 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
421 aa  169  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  34.31 
 
 
410 aa  169  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  32.67 
 
 
450 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
424 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
424 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  31.05 
 
 
407 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  31.05 
 
 
407 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  32.09 
 
 
450 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  30.81 
 
 
407 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  30.81 
 
 
407 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  32.68 
 
 
420 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  30.81 
 
 
407 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
411 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  31.09 
 
 
433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  30.81 
 
 
407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 
517 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  30.56 
 
 
407 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  30.07 
 
 
407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  30.56 
 
 
407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  30.56 
 
 
407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  30.32 
 
 
407 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  32.82 
 
 
435 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  30.32 
 
 
407 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1607  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
407 aa  144  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0834278  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  29.64 
 
 
407 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  28.26 
 
 
406 aa  139  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
404 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
415 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
406 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  31.77 
 
 
405 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
412 aa  126  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  30.15 
 
 
415 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
406 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 
411 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 
409 aa  123  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
409 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  29.56 
 
 
413 aa  109  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
420 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  23.59 
 
 
415 aa  106  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
414 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
408 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
419 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
423 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
418 aa  100  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
405 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1493  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  25.46 
 
 
407 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  29.65 
 
 
428 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
418 aa  92.8  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  23.98 
 
 
475 aa  90.5  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
403 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  22.43 
 
 
411 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  23.37 
 
 
395 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  27.73 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0146  glycosyl transferase, group 1  22.95 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0151  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.16 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
566 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  27.18 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  24.01 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.45 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  22.45 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.45 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
421 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
457 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  21.04 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1282  glycosyltransferase-like protein  20.45 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  24.33 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.21 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  21.65 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  18.8 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4749  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
407 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000897702  normal  0.0900271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>