More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3328 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
412 aa  835    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  46.36 
 
 
420 aa  353  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  45.36 
 
 
407 aa  309  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  42.01 
 
 
403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  39.6 
 
 
517 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  39.6 
 
 
441 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
408 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 
412 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
418 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  35.57 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
408 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
427 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
423 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.74 
 
 
409 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  28.09 
 
 
421 aa  199  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
421 aa  192  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
421 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  30.02 
 
 
429 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
404 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
424 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
424 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 
413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  35.29 
 
 
413 aa  172  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
407 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.94 
 
 
413 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  26.94 
 
 
413 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.94 
 
 
413 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 
405 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  29.76 
 
 
417 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
436 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
422 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
409 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
403 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
409 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
414 aa  142  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  28.36 
 
 
417 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
412 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  28.02 
 
 
397 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  30.25 
 
 
428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
411 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
427 aa  130  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  24.56 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 
415 aa  126  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
419 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
418 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
412 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
416 aa  123  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
401 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
405 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
395 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  22.82 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  24.35 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  23.24 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.17 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.4 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  31.03 
 
 
390 aa  111  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
416 aa  110  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  27.86 
 
 
415 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  25.55 
 
 
450 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  25.68 
 
 
450 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  27.5 
 
 
557 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 
412 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
405 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
535 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
406 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
402 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  26.3 
 
 
415 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  25.62 
 
 
410 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  26.38 
 
 
420 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  26.08 
 
 
435 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
411 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
575 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  27.27 
 
 
407 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  30.33 
 
 
394 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  27.03 
 
 
407 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  24.46 
 
 
388 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  26.79 
 
 
421 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
405 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
423 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  26.79 
 
 
407 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
406 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  26.79 
 
 
407 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  22.52 
 
 
406 aa  101  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
402 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  26.79 
 
 
407 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  21.24 
 
 
401 aa  100  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
400 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 
404 aa  99  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>