120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4068 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
400 aa  819    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  43.92 
 
 
391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  43.33 
 
 
370 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  37.56 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 
413 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  25.92 
 
 
420 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.32 
 
 
413 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.32 
 
 
413 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  27.32 
 
 
413 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
412 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
517 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
421 aa  92.8  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
418 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.39 
 
 
409 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  23.44 
 
 
421 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
403 aa  87  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  25.3 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  23.68 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  26.21 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  23.08 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
427 aa  73.2  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
419 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  27.53 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
424 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
424 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  25.3 
 
 
407 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  25.18 
 
 
429 aa  64.3  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  27.03 
 
 
407 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
415 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  27.03 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  23.35 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 
395 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
416 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  26.32 
 
 
407 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  26.32 
 
 
407 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  26.32 
 
 
407 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
409 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 
423 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
421 aa  59.7  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  22.85 
 
 
403 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20940  glycosyltransferase  24.11 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  27.72 
 
 
452 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
408 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  20.97 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  21.89 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  26.54 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  25.97 
 
 
417 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
423 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
418 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
425 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  22.26 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  22.35 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  35.79 
 
 
407 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1607  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 
407 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0834278  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  22.37 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 
380 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  23.5 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  27.46 
 
 
464 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  35.79 
 
 
407 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  25 
 
 
407 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  26.25 
 
 
407 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  35.79 
 
 
407 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  35.79 
 
 
407 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  22.48 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  27.32 
 
 
410 aa  50.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  24.88 
 
 
429 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
359 aa  49.7  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  34.74 
 
 
407 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  26.91 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
436 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1282  glycosyltransferase-like protein  24.33 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  21.19 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
405 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  24.8 
 
 
404 aa  47.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1819  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
439 aa  47  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00811272  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  22.62 
 
 
404 aa  46.6  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  21.07 
 
 
364 aa  46.6  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>