136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2418 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 388 aa  792    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 429 aa  126  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  30.51 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  29.16 
 
 		 443 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  25.98 
 
 		 415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  28.88 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  26.81 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  27.44 
 
 		 416 aa  106  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  29.23 
 
 		 429 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  27.54 
 
 		 452 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  29.14 
 
 		 405 aa  99.4  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  29.68 
 
 		 464 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  28.57 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  25.6 
 
 		 567 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  25.6 
 
 		 567 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  28.28 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  30.15 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  26.01 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  24.48 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  26.22 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  25.32 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  25.23 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  24.1 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3132  hypothetical protein  28.52 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.290688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  25.15 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  23 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 519 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  23.14 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  20.82 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1493  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  22.68 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  20.78 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 517 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 		 390 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 416 aa  53.1  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3508  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 379 aa  53.1  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8743499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  24.76 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  20.53 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  25.56 
 
 		 603 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4581  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  21.25 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  24.35 
 
 		 726 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3800  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 392 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0666  hypothetical protein  23.62 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.202618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 		 412 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  23.73 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  28.18 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  22.61 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 540 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0174  hypothetical protein  31.4 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000353751  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 441 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  21.47 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  20.23 
 
 		 431 aa  47  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 382 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0324  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.546563  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 403 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  18.85 
 
 		 440 aa  46.6  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 419 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  23 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 		 409 aa  46.2  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>