167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1687 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  80.92 
 
 
517 aa  811    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
519 aa  1045    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  58.05 
 
 
550 aa  557  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  60.04 
 
 
540 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  53.78 
 
 
447 aa  339  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  37.69 
 
 
516 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 
859 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 
545 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4643  glycosyl transferase group 1  36.58 
 
 
518 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39122  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
507 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  32.35 
 
 
861 aa  167  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  31.89 
 
 
484 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
377 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 
401 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
415 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  22.04 
 
 
433 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.22 
 
 
424 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  21.97 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.64 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
522 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20960  hypothetical protein  27.83 
 
 
373 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
405 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
388 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
373 aa  63.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 
378 aa  62  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
517 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  26.24 
 
 
388 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
441 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
379 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08670  hypothetical protein  28.15 
 
 
378 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6507  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
383 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.961113  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  29.14 
 
 
416 aa  57.4  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
419 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
380 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
453 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
475 aa  55.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  21.72 
 
 
408 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
405 aa  54.7  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
376 aa  54.3  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
353 aa  53.9  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
379 aa  53.5  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  22.33 
 
 
381 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  22.26 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
403 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
377 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
445 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
373 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
399 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  21.36 
 
 
410 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
375 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
417 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
361 aa  51.2  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  25.7 
 
 
569 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  26.38 
 
 
432 aa  50.4  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
405 aa  50.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  20.6 
 
 
366 aa  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.51 
 
 
398 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  22.75 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4036  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
592 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212035  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
413 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
416 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
430 aa  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
393 aa  49.7  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
377 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 
419 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 
409 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.21 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  22.6 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
436 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  20.43 
 
 
396 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2253  hypothetical protein  21.22 
 
 
386 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0192058  hitchhiker  0.00258376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  22.59 
 
 
564 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
376 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  30.23 
 
 
440 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
390 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  23.04 
 
 
340 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  22.6 
 
 
393 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 
399 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  20.5 
 
 
377 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
374 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
395 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 
425 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
433 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
388 aa  47.4  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
395 aa  47.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
377 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  18.96 
 
 
386 aa  47.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
384 aa  47.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
403 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
403 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>