More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7635 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
507 aa  1030    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 
550 aa  279  8e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  37.08 
 
 
540 aa  269  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
859 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 
516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  35.92 
 
 
517 aa  253  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
447 aa  240  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
519 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
545 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  37.14 
 
 
861 aa  187  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4643  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
518 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39122  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  27.4 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
401 aa  91.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  23.99 
 
 
430 aa  87.4  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  21.99 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  23.51 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0324  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.546563  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
380 aa  67  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
481 aa  65.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
388 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
388 aa  64.3  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 
394 aa  64.3  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
419 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
410 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  24.24 
 
 
404 aa  63.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
370 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
453 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
404 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.41 
 
 
394 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  23.28 
 
 
425 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  28.27 
 
 
468 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
402 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.86 
 
 
424 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
463 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  21.86 
 
 
432 aa  60.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
372 aa  60.1  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.86 
 
 
432 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.48 
 
 
398 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
445 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
424 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6507  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
383 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.961113  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
522 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20960  hypothetical protein  30.53 
 
 
373 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
369 aa  58.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
391 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  21.8 
 
 
414 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  30.67 
 
 
416 aa  58.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
406 aa  57.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
395 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
398 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
415 aa  57  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
373 aa  57  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 
378 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  25.65 
 
 
395 aa  56.6  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 
427 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
369 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  29.79 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
377 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  21.97 
 
 
423 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  25.92 
 
 
406 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  26.23 
 
 
340 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  26.94 
 
 
392 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
396 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
457 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  21.17 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
399 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
369 aa  55.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
445 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 
387 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  21.23 
 
 
390 aa  54.7  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
371 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
374 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  27.59 
 
 
838 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.91 
 
 
398 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  22.6 
 
 
433 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
411 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
419 aa  54.3  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
419 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
376 aa  54.3  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
396 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
396 aa  54.3  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
393 aa  53.9  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
392 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
405 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
416 aa  53.9  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
393 aa  53.5  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
371 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
477 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>