194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4204 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 398 aa  806    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  36.86 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  46.11 
 
 		 741 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  42.18 
 
 		 751 aa  267  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  41.58 
 
 		 754 aa  248  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  35.79 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  35.79 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  36.06 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 		 705 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  28.93 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  35.86 
 
 		 814 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 385 aa  152  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  37.07 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  27.76 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 		 416 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  28.68 
 
 		 375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  34.83 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  28.91 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  35.36 
 
 		 420 aa  146  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  33.67 
 
 		 405 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 422 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  35.11 
 
 		 783 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  34.01 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  34.4 
 
 		 783 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  33.22 
 
 		 1293 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  36.8 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  31.14 
 
 		 443 aa  122  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  24.94 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  32.46 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 406 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  34 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.3 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  26.45 
 
 		 1119 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  31.04 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  34.87 
 
 		 388 aa  99.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  29.37 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  26.51 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 729 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.72 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.72 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  30.81 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  26.53 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  29.2 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 728 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.76 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 728 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  22.56 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  28.57 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 903 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  27.66 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  31.25 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  36.21 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  27.38 
 
 		 726 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  25.11 
 
 		 942 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 904 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  29.57 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  24.73 
 
 		 723 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3251  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 		 374 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  22.47 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08670  hypothetical protein  39.18 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  31.87 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0324  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.546563  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 859 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  25.65 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>