179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5685 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  71.56 
 
 		 783 aa  1135    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 783 aa  1628    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  53.88 
 
 		 814 aa  846    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  69.06 
 
 		 398 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  68.02 
 
 		 393 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  67.03 
 
 		 379 aa  525  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  68.14 
 
 		 393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  65.07 
 
 		 390 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  62.09 
 
 		 373 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  63.68 
 
 		 399 aa  491  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  62.73 
 
 		 372 aa  480  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  61.85 
 
 		 383 aa  469  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  60.11 
 
 		 377 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  57.65 
 
 		 363 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  57.34 
 
 		 369 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  55.7 
 
 		 420 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  53.46 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  52.38 
 
 		 394 aa  360  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  51.54 
 
 		 394 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  47.06 
 
 		 422 aa  354  2.9999999999999997e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  48.89 
 
 		 403 aa  351  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  45.83 
 
 		 364 aa  351  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  46.76 
 
 		 376 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  46.81 
 
 		 405 aa  343  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  48.92 
 
 		 375 aa  343  7e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  47.97 
 
 		 373 aa  342  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  49.73 
 
 		 376 aa  341  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  42.06 
 
 		 1293 aa  339  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  45.95 
 
 		 376 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  48.65 
 
 		 385 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  48.65 
 
 		 382 aa  334  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  44.01 
 
 		 386 aa  324  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  46.56 
 
 		 369 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  47.72 
 
 		 412 aa  319  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  42.93 
 
 		 404 aa  315  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  41.87 
 
 		 370 aa  303  6.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  42.08 
 
 		 391 aa  303  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  39.27 
 
 		 382 aa  295  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  41.34 
 
 		 391 aa  290  6e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  42.67 
 
 		 400 aa  289  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  41.49 
 
 		 415 aa  283  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  40.77 
 
 		 460 aa  281  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  41.56 
 
 		 395 aa  279  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  43.44 
 
 		 383 aa  278  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  40.32 
 
 		 384 aa  277  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  41.14 
 
 		 381 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 395 aa  273  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  40.77 
 
 		 383 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  40.5 
 
 		 383 aa  269  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  41.21 
 
 		 367 aa  268  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  39.85 
 
 		 394 aa  267  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  40.22 
 
 		 383 aa  267  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  41.37 
 
 		 371 aa  265  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 389 aa  265  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  39.19 
 
 		 381 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 		 395 aa  263  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  38.28 
 
 		 391 aa  263  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  38.25 
 
 		 367 aa  260  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  39.67 
 
 		 370 aa  259  9e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  38.54 
 
 		 367 aa  259  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  40.5 
 
 		 381 aa  259  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  37.8 
 
 		 395 aa  259  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  38.54 
 
 		 398 aa  258  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  39.68 
 
 		 395 aa  258  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  38.04 
 
 		 366 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  39.67 
 
 		 365 aa  256  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  38.11 
 
 		 380 aa  255  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  39.56 
 
 		 372 aa  254  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  37.14 
 
 		 428 aa  253  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  38.75 
 
 		 372 aa  253  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  39.83 
 
 		 383 aa  251  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  38.42 
 
 		 395 aa  251  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  37.73 
 
 		 383 aa  251  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  38.24 
 
 		 370 aa  250  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  37.5 
 
 		 368 aa  250  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  37.95 
 
 		 399 aa  250  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  37.95 
 
 		 399 aa  250  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  36.72 
 
 		 392 aa  249  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  38.07 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  38.98 
 
 		 381 aa  248  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  38.36 
 
 		 395 aa  248  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  38.16 
 
 		 409 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  38.11 
 
 		 399 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  37.95 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  37.95 
 
 		 413 aa  244  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  36.84 
 
 		 402 aa  244  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  37.63 
 
 		 386 aa  243  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  35.73 
 
 		 391 aa  242  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  38.89 
 
 		 399 aa  239  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 		 413 aa  228  4e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  41.56 
 
 		 443 aa  226  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 385 aa  153  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  28.32 
 
 		 388 aa  147  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 389 aa  139  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 		 398 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  26.42 
 
 		 434 aa  138  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 390 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  30.14 
 
 		 443 aa  134  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 392 aa  126  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 397 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>