85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1159 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  82.23 
 
 
398 aa  684    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  93.73 
 
 
413 aa  780    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  88.89 
 
 
399 aa  741    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  88.89 
 
 
399 aa  741    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 
425 aa  877    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  87.63 
 
 
399 aa  727    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  87.74 
 
 
428 aa  761    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  81.28 
 
 
402 aa  677    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  76.92 
 
 
394 aa  628  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  75.64 
 
 
415 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  70.73 
 
 
395 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  73.2 
 
 
389 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  67.77 
 
 
395 aa  543  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  67.78 
 
 
395 aa  543  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  66.67 
 
 
395 aa  538  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  66.32 
 
 
395 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  67.35 
 
 
395 aa  532  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  64.43 
 
 
409 aa  525  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  67.97 
 
 
386 aa  526  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  64.95 
 
 
395 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  62.33 
 
 
381 aa  489  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  60.41 
 
 
399 aa  460  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  59.42 
 
 
383 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  56.74 
 
 
392 aa  451  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  54.95 
 
 
413 aa  441  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  44.85 
 
 
366 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  46.26 
 
 
372 aa  325  1e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  45.99 
 
 
380 aa  319  6e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  44.04 
 
 
384 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  43.42 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  43.65 
 
 
367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  45.14 
 
 
372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  43.94 
 
 
367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  43.28 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  44.32 
 
 
368 aa  305  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  42.93 
 
 
370 aa  305  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  45.21 
 
 
370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  42.78 
 
 
383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  43.82 
 
 
367 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  44.24 
 
 
383 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  42.33 
 
 
365 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  43.67 
 
 
381 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  41.8 
 
 
391 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  41.55 
 
 
381 aa  289  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  42.35 
 
 
381 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  41.22 
 
 
383 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  41.22 
 
 
383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  40.96 
 
 
383 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  42.15 
 
 
371 aa  280  3e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  38.34 
 
 
364 aa  270  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  40.27 
 
 
379 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  40.83 
 
 
376 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  37.82 
 
 
814 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  40.83 
 
 
376 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  39.95 
 
 
398 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  39.79 
 
 
372 aa  265  8e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  38.54 
 
 
373 aa  262  8.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  37.78 
 
 
393 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  37.77 
 
 
393 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  38.83 
 
 
383 aa  256  7e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  40.16 
 
 
399 aa  253  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  38.52 
 
 
377 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  35.19 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  37.95 
 
 
783 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  38.48 
 
 
460 aa  242  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  36.15 
 
 
373 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  35.79 
 
 
386 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  37.96 
 
 
363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  35.22 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  37.27 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  33.85 
 
 
382 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  37.67 
 
 
369 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  36.65 
 
 
783 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  36.43 
 
 
391 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  35.17 
 
 
375 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  35.16 
 
 
404 aa  210  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  34.45 
 
 
400 aa  207  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  33.42 
 
 
369 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  24.55 
 
 
369 aa  67  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  25.73 
 
 
459 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  25.73 
 
 
459 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  26.63 
 
 
424 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  24.43 
 
 
394 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  26.32 
 
 
519 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 
554 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>