112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1143 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 372 aa  765    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  81.89 
 
 		 372 aa  640    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  68.02 
 
 		 367 aa  527  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  63.93 
 
 		 366 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  64.59 
 
 		 391 aa  504  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  63.22 
 
 		 368 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  65.58 
 
 		 380 aa  496  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  63.1 
 
 		 396 aa  489  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  61.92 
 
 		 367 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  60.76 
 
 		 370 aa  481  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  63.22 
 
 		 370 aa  482  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  58.31 
 
 		 365 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  58.7 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  48.94 
 
 		 389 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  46.84 
 
 		 386 aa  349  4e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  46.97 
 
 		 409 aa  345  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  46.17 
 
 		 395 aa  344  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  46.32 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  45.93 
 
 		 395 aa  342  7e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  47.06 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  47.35 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  46.11 
 
 		 394 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  46.68 
 
 		 413 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  46.9 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  46.26 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  46.6 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  44.74 
 
 		 395 aa  329  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  46.6 
 
 		 399 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  46.6 
 
 		 399 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  46.24 
 
 		 392 aa  329  4e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  46.26 
 
 		 425 aa  325  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  45.72 
 
 		 399 aa  325  7e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  43.29 
 
 		 413 aa  325  9e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  45.38 
 
 		 395 aa  323  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  46.11 
 
 		 402 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  45.92 
 
 		 367 aa  315  7e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  41.29 
 
 		 381 aa  312  5.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  42.9 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  42.62 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  42.62 
 
 		 383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  42.02 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  43.84 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  45.08 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  43.68 
 
 		 381 aa  295  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  43.09 
 
 		 383 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  43.56 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  42.47 
 
 		 381 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  42.31 
 
 		 384 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  40.9 
 
 		 399 aa  289  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  41.44 
 
 		 373 aa  282  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  41.42 
 
 		 376 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  41.69 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  38.42 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 		 379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  38.57 
 
 		 393 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  40.38 
 
 		 398 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  39.19 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  39.67 
 
 		 814 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  40.77 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  38.95 
 
 		 372 aa  259  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  39.53 
 
 		 386 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  37.57 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  38.52 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  39.04 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  40.27 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  39.05 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  38.75 
 
 		 783 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  38.3 
 
 		 382 aa  245  9e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  38.31 
 
 		 369 aa  245  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  38.4 
 
 		 460 aa  239  5e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  38.17 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  37.07 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  39.3 
 
 		 783 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  36.34 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  36.68 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  38.03 
 
 		 375 aa  233  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  37.34 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  34.55 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  27.37 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  25.99 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  20.19 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  27.98 
 
 		 494 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  26.16 
 
 		 511 aa  53.5  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  28.05 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  27.53 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  25.88 
 
 		 496 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  26.9 
 
 		 498 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  25.6 
 
 		 516 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.44 
 
 		 435 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  21.49 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  34.12 
 
 		 465 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  30.56 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  31.67 
 
 		 537 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  43.1 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  24.29 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  25.58 
 
 		 500 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  27.17 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  28.89 
 
 		 647 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  20.99 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  25.45 
 
 		 511 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>