More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3017 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  1001    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  68.18 
 
 
476 aa  696    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3186  hypothetical protein  90.38 
 
 
239 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834271  hitchhiker  0.00173246 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  87.01 
 
 
245 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  40.71 
 
 
468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  40.5 
 
 
468 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  40.33 
 
 
468 aa  282  1e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1495  hypothetical protein  36.82 
 
 
485 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1151  hypothetical protein  38.69 
 
 
465 aa  259  8e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  29.21 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.45 
 
 
556 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
547 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  45 
 
 
525 aa  64.7  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  24.23 
 
 
503 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  29.19 
 
 
505 aa  63.5  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  23.09 
 
 
522 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  34.07 
 
 
495 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  23.35 
 
 
505 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 
510 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  29.01 
 
 
441 aa  61.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  43.68 
 
 
544 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  53.85 
 
 
507 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 
503 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  42.25 
 
 
537 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  61.9 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  45.59 
 
 
479 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.5 
 
 
511 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  61.9 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  37.93 
 
 
504 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  50 
 
 
508 aa  58.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  44.07 
 
 
436 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  26.77 
 
 
436 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  44.07 
 
 
436 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  44.07 
 
 
436 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  42.37 
 
 
436 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  42.11 
 
 
366 aa  57.8  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  27.27 
 
 
509 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  34.52 
 
 
365 aa  57.4  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  44.07 
 
 
436 aa  57.4  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.35 
 
 
740 aa  57  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  44.07 
 
 
436 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  44.07 
 
 
436 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
488 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  35.53 
 
 
508 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 
547 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  35.63 
 
 
509 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  22.55 
 
 
509 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  30.3 
 
 
509 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  31.25 
 
 
501 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  53.57 
 
 
401 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  48.28 
 
 
508 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  53.57 
 
 
401 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
495 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  42.37 
 
 
436 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  33.62 
 
 
512 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  33.62 
 
 
512 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  48.21 
 
 
512 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  49.09 
 
 
512 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  23.55 
 
 
516 aa  54.7  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  35.53 
 
 
511 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  43.94 
 
 
425 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  40.26 
 
 
507 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  48.28 
 
 
372 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  48.21 
 
 
506 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  37.14 
 
 
501 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  43.14 
 
 
342 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  21.88 
 
 
502 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  51.79 
 
 
843 aa  53.9  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  36.36 
 
 
505 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
496 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  24.84 
 
 
370 aa  53.9  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  40.68 
 
 
436 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  48.21 
 
 
512 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  36.84 
 
 
505 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0264  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  60 
 
 
174 aa  53.5  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  40.62 
 
 
470 aa  53.5  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  23.18 
 
 
527 aa  53.5  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  27.04 
 
 
495 aa  53.5  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  23.19 
 
 
532 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  23.16 
 
 
503 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  38.46 
 
 
368 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  45.1 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  24.45 
 
 
506 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 
554 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  50 
 
 
400 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
510 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  38.89 
 
 
434 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  53.06 
 
 
391 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  38.1 
 
 
492 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  36.36 
 
 
509 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 
559 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
346 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  35.53 
 
 
501 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 
536 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  43.64 
 
 
503 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  37.66 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 
342 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  37.18 
 
 
501 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  46.43 
 
 
938 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>