217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2880 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  75.6 
 
 		 511 aa  788    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  64.41 
 
 		 500 aa  674    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  65.41 
 
 		 500 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  63.42 
 
 		 500 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1055    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  57.63 
 
 		 507 aa  578  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  48.17 
 
 		 496 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  52.1 
 
 		 516 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  47.7 
 
 		 480 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  50.4 
 
 		 512 aa  455  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  50.51 
 
 		 494 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  52.84 
 
 		 524 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  48.88 
 
 		 498 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  46.73 
 
 		 520 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  44.78 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  39.79 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  38.68 
 
 		 519 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  37.52 
 
 		 549 aa  360  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  37.7 
 
 		 1033 aa  349  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  36.87 
 
 		 538 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  34.7 
 
 		 537 aa  292  8e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 		 539 aa  280  5e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  36.88 
 
 		 465 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  34.93 
 
 		 463 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  34.72 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  34.72 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  34.81 
 
 		 436 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  28.67 
 
 		 449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  26.76 
 
 		 465 aa  157  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  27.49 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 722 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  26.7 
 
 		 447 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  28.35 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  26.82 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  24.31 
 
 		 459 aa  133  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  23.88 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.58 
 
 		 435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  23.01 
 
 		 532 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  27.79 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  27.48 
 
 		 491 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  23.42 
 
 		 452 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  23.72 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  24.85 
 
 		 538 aa  103  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  26.89 
 
 		 452 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  25.22 
 
 		 428 aa  97.4  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  22.54 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  23.99 
 
 		 449 aa  90.1  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  21.54 
 
 		 428 aa  87.8  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  26.33 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  23.21 
 
 		 1293 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  22.55 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  27.75 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  30.53 
 
 		 647 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  25.07 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  30.53 
 
 		 647 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  28 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  25.42 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  28.92 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  26.74 
 
 		 645 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  27.09 
 
 		 647 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  28.14 
 
 		 372 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  28.99 
 
 		 373 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  36.11 
 
 		 497 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  40.23 
 
 		 525 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  27.12 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  27.27 
 
 		 384 aa  52  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 465 aa  51.6  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  23.45 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  38.57 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  30.11 
 
 		 369 aa  52  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  39.74 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  23.26 
 
 		 469 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0525  thioredoxin-disulfide reductase  29.86 
 
 		 326 aa  51.2  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 520 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 520 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 520 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  24.58 
 
 		 441 aa  51.6  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  24.71 
 
 		 396 aa  51.2  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  45.45 
 
 		 501 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  47.37 
 
 		 455 aa  50.4  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  37.14 
 
 		 413 aa  50.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  42.5 
 
 		 525 aa  50.4  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  20.3 
 
 		 427 aa  50.1  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  47.06 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  31.78 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  22.71 
 
 		 501 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  27.22 
 
 		 367 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  25.97 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  20.3 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  27.65 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.372109  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  43.64 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  42.86 
 
 		 494 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  27.65 
 
 		 383 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  26.19 
 
 		 366 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  23.87 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  27.65 
 
 		 383 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>