86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1579 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  82.11 
 
 		 413 aa  690    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 392 aa  813    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  65.36 
 
 		 386 aa  519  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  65.26 
 
 		 395 aa  519  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  64.74 
 
 		 409 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  63.02 
 
 		 395 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  62.11 
 
 		 395 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  61.2 
 
 		 395 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  58.03 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  58.14 
 
 		 394 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  58.01 
 
 		 381 aa  459  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  58.68 
 
 		 389 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  57.07 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  56.74 
 
 		 425 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  56.7 
 
 		 428 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  56.7 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  56.7 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  57.44 
 
 		 395 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  56.7 
 
 		 395 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  55.67 
 
 		 395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  57.03 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  56.22 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  56.1 
 
 		 415 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  54.41 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  53.03 
 
 		 383 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  46.58 
 
 		 372 aa  341  1e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  46.24 
 
 		 372 aa  329  4e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  44.09 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  45.53 
 
 		 381 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  44.39 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  44.74 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  46.9 
 
 		 383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  43.68 
 
 		 367 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  45.07 
 
 		 381 aa  316  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  43.94 
 
 		 383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  43.67 
 
 		 383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  42.6 
 
 		 380 aa  313  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  43.67 
 
 		 383 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  43.5 
 
 		 391 aa  311  9e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  43.13 
 
 		 367 aa  309  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  44.35 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  42.86 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  43.13 
 
 		 371 aa  298  8e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  40.21 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  42.63 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  41.24 
 
 		 370 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  41.62 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  41.16 
 
 		 391 aa  291  9e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  39.64 
 
 		 396 aa  280  4e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  38.74 
 
 		 814 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  38.67 
 
 		 393 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  39.1 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  39.57 
 
 		 379 aa  266  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  38.89 
 
 		 383 aa  263  4.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  37.6 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  37.83 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  37.5 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  37.63 
 
 		 376 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  37.23 
 
 		 377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  37.37 
 
 		 376 aa  252  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  38.26 
 
 		 373 aa  252  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  39.79 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  39.15 
 
 		 399 aa  249  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  36.72 
 
 		 783 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  36.46 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  38.79 
 
 		 783 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  37.97 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  35.86 
 
 		 460 aa  235  9e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  34.67 
 
 		 386 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  36.68 
 
 		 370 aa  232  7.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  37.2 
 
 		 369 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  33.51 
 
 		 382 aa  226  8e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  34.26 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  31.2 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  32.55 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  32.65 
 
 		 400 aa  199  6e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  32.37 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  23.7 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  29.3 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  22.91 
 
 		 394 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  27.61 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  35.62 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  24.71 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  22.41 
 
 		 459 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  36.99 
 
 		 457 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>