84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5440 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 369 aa  759    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  52.17 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  51.48 
 
 		 375 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  51.09 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  47.01 
 
 		 373 aa  363  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  49.18 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  50.14 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  45.05 
 
 		 386 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  49.32 
 
 		 398 aa  352  8e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  48.64 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  42.37 
 
 		 382 aa  346  3e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  44.57 
 
 		 383 aa  345  7e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  47.14 
 
 		 393 aa  339  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  46.05 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  42.66 
 
 		 814 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  42.56 
 
 		 391 aa  324  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  44.99 
 
 		 377 aa  323  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  45.92 
 
 		 783 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  46.88 
 
 		 783 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  44.07 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  45.78 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  42.93 
 
 		 400 aa  305  8.000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  39.24 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  45.81 
 
 		 369 aa  292  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  39.47 
 
 		 376 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  38.95 
 
 		 376 aa  258  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  36.78 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  40.8 
 
 		 370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  37.83 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  36.91 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  36.41 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  37.77 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  36.68 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  39.14 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  37.47 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  38.25 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  34.76 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  37.36 
 
 		 383 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  36.93 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  35.79 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  37.36 
 
 		 383 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  37.09 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  35.97 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  38.07 
 
 		 391 aa  215  9e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  34.6 
 
 		 391 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  35.03 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  39.23 
 
 		 381 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  33.88 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  35.26 
 
 		 395 aa  209  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  35.17 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  34.83 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  34.4 
 
 		 398 aa  206  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  36.64 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  36.02 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  31.72 
 
 		 391 aa  202  7e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  34.97 
 
 		 395 aa  202  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  34.03 
 
 		 381 aa  202  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  35.16 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  34.66 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  34.66 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  34.66 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  35.45 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  34.04 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  33.96 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  35.18 
 
 		 383 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  34.13 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  36.44 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  35.13 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  34.04 
 
 		 413 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  33.77 
 
 		 402 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  33.42 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  34.12 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  33.69 
 
 		 399 aa  192  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  33.87 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  33.95 
 
 		 395 aa  189  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  32.37 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  35.08 
 
 		 399 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  31.57 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  22.77 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  23.53 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  27.85 
 
 		 484 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  25.32 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  26.46 
 
 		 472 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  26.7 
 
 		 476 aa  43.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>