100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0128 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 394 aa  814    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  81.38 
 
 		 415 aa  673    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  77.89 
 
 		 413 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  76.92 
 
 		 399 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  76.92 
 
 		 399 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  77.1 
 
 		 398 aa  631  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  76.92 
 
 		 425 aa  628  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  76.92 
 
 		 428 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  76.35 
 
 		 399 aa  620  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  73.6 
 
 		 395 aa  616  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  74.48 
 
 		 402 aa  611  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  72.82 
 
 		 389 aa  588  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  70.44 
 
 		 395 aa  567  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  69.59 
 
 		 395 aa  559  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  67.77 
 
 		 395 aa  561  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  68.53 
 
 		 395 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  68.01 
 
 		 395 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  66.24 
 
 		 395 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  65.83 
 
 		 409 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  65.26 
 
 		 386 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  64.38 
 
 		 381 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  60.69 
 
 		 383 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  59.75 
 
 		 399 aa  471  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  55.94 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  58.14 
 
 		 392 aa  459  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  47.61 
 
 		 372 aa  345  1e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  45.6 
 
 		 366 aa  339  5e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  45.77 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  46.11 
 
 		 372 aa  335  1e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  45.97 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  43.85 
 
 		 384 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  45.21 
 
 		 383 aa  325  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  43.48 
 
 		 367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  44.3 
 
 		 367 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  43.84 
 
 		 381 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  44.29 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  42.04 
 
 		 391 aa  315  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  43.48 
 
 		 370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  44.57 
 
 		 383 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  43.99 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  44.59 
 
 		 370 aa  309  6.999999999999999e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  43.4 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  42.67 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  42.74 
 
 		 381 aa  302  7.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  42.74 
 
 		 814 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  41.35 
 
 		 383 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  41.62 
 
 		 383 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  41.38 
 
 		 396 aa  296  3e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  42.82 
 
 		 398 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  41.35 
 
 		 383 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  42.16 
 
 		 372 aa  292  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  42.18 
 
 		 371 aa  292  8e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  43.73 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  43.73 
 
 		 376 aa  288  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  40.8 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  40.27 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  40.47 
 
 		 377 aa  280  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  40.53 
 
 		 383 aa  277  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 		 364 aa  276  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  39.19 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  42.78 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  41.51 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 390 aa  272  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  39.85 
 
 		 783 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  40.56 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  37.67 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  36.62 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  41.26 
 
 		 369 aa  253  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  37.8 
 
 		 373 aa  253  6e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  37.91 
 
 		 783 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  37.24 
 
 		 386 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  34.96 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  37.77 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  38.29 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  36.02 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  33.25 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  34.13 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.26 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  25.42 
 
 		 459 aa  50.1  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  37.86 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  25.42 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  37.93 
 
 		 245 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  35.14 
 
 		 492 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  34.57 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  40.54 
 
 		 544 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  29 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  36.9 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  52.17 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  52.17 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  52.27 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  52.38 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  52.27 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  22.16 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  54.76 
 
 		 513 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  26.06 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  50 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4690  Cyclohexanone monooxygenase  43.86 
 
 		 490 aa  43.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557659  normal  0.132484 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  55.81 
 
 		 554 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>