161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3019 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 381 aa  797    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  62.67 
 
 		 383 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  62.5 
 
 		 391 aa  512  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  60.64 
 
 		 381 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  61.38 
 
 		 384 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  61.7 
 
 		 381 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  61.01 
 
 		 383 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  63.46 
 
 		 367 aa  494  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  59.1 
 
 		 383 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  58.84 
 
 		 383 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  58.84 
 
 		 383 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  45.23 
 
 		 395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  45.5 
 
 		 409 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  45.53 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  43.35 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  43.43 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  43.47 
 
 		 395 aa  322  6e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  42.62 
 
 		 389 aa  320  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  43.4 
 
 		 395 aa  319  5e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  45.21 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  43.55 
 
 		 399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  42.51 
 
 		 395 aa  312  5.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  43.99 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  43.21 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  42.29 
 
 		 386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  41.56 
 
 		 413 aa  305  9.000000000000001e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  41.4 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  45.92 
 
 		 367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  40.58 
 
 		 383 aa  302  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  43.77 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  43.21 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  42.63 
 
 		 399 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  42.63 
 
 		 399 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  43.68 
 
 		 372 aa  295  7e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  42.62 
 
 		 365 aa  293  3e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  40.96 
 
 		 399 aa  292  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  42.01 
 
 		 398 aa  292  7e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  43.21 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  42.61 
 
 		 369 aa  290  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  41.29 
 
 		 413 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  41.44 
 
 		 402 aa  289  7e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  41.55 
 
 		 425 aa  289  7e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  44.96 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  40.7 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  41.6 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  41.14 
 
 		 380 aa  282  7.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  41.94 
 
 		 370 aa  279  5e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  42.7 
 
 		 366 aa  278  8e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  41.16 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  41 
 
 		 377 aa  277  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  43.3 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  42.7 
 
 		 363 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  41.18 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  41.14 
 
 		 783 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  39.46 
 
 		 393 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  41.19 
 
 		 370 aa  275  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  41.71 
 
 		 371 aa  273  5.000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  39.79 
 
 		 396 aa  272  8.000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  42.06 
 
 		 814 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  38.67 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  39.2 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  40.82 
 
 		 373 aa  269  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  42.5 
 
 		 383 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  41.44 
 
 		 376 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  41.71 
 
 		 376 aa  265  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  40.66 
 
 		 783 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  40.65 
 
 		 370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  39.29 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  38.2 
 
 		 382 aa  253  6e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  37.63 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  38.28 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  39.07 
 
 		 391 aa  242  6e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  35.22 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  34.46 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  36.36 
 
 		 460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  33.88 
 
 		 369 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  35.64 
 
 		 375 aa  202  6e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  33.51 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  26.54 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  26.51 
 
 		 459 aa  57  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  24.73 
 
 		 465 aa  57  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  26.05 
 
 		 459 aa  53.9  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  36.84 
 
 		 479 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  36.36 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  38.67 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  37.33 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  28.92 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  35.53 
 
 		 484 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  36.84 
 
 		 591 aa  50.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  33.8 
 
 		 418 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  42.37 
 
 		 489 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  35.53 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  32.91 
 
 		 453 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  25.36 
 
 		 500 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  27.84 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  30.99 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  35.21 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.86 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  22.22 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  34.72 
 
 		 478 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>