194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_53974 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  100 
 
 		 591 aa  1223    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  58.4 
 
 		 489 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  57.44 
 
 		 479 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  58.26 
 
 		 479 aa  583  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  57.79 
 
 		 483 aa  578  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  56.56 
 
 		 490 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  56.56 
 
 		 490 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  56.81 
 
 		 482 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  54.75 
 
 		 481 aa  530  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  53.93 
 
 		 478 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  54.13 
 
 		 488 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  53.11 
 
 		 488 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  52.15 
 
 		 499 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  52.06 
 
 		 484 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  52.26 
 
 		 484 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  51.13 
 
 		 486 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  51.33 
 
 		 486 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  51.44 
 
 		 484 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  52.48 
 
 		 490 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  33.13 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  31.76 
 
 		 455 aa  251  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  32.59 
 
 		 453 aa  250  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  32.79 
 
 		 453 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  32.18 
 
 		 453 aa  243  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  31.77 
 
 		 453 aa  242  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  32.69 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  32.19 
 
 		 453 aa  237  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  33.27 
 
 		 479 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  32.28 
 
 		 463 aa  226  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  31.76 
 
 		 479 aa  223  6e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  30.94 
 
 		 472 aa  223  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  32.05 
 
 		 475 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  31.15 
 
 		 471 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  31.85 
 
 		 475 aa  220  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  31.59 
 
 		 472 aa  219  8.999999999999998e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  32.19 
 
 		 472 aa  219  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  29.78 
 
 		 589 aa  219  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  30.88 
 
 		 465 aa  216  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  30.12 
 
 		 472 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  30.89 
 
 		 466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  31.1 
 
 		 466 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  32.53 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  30.43 
 
 		 464 aa  210  6e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  30.43 
 
 		 473 aa  210  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  30.58 
 
 		 462 aa  209  8e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  28.71 
 
 		 624 aa  206  9e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  30.16 
 
 		 459 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  28.96 
 
 		 599 aa  204  5e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  28.81 
 
 		 461 aa  191  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  28.25 
 
 		 460 aa  190  7e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  29.98 
 
 		 552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  28.87 
 
 		 462 aa  170  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  28.22 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  27.86 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  28.9 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  26.61 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  27.07 
 
 		 481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  23.22 
 
 		 451 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.31 
 
 		 439 aa  110  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  24.75 
 
 		 500 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  23.88 
 
 		 503 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  23.67 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.68 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  23.87 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  23.87 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.61 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  22.42 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  22.42 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  22.42 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  24.4 
 
 		 520 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  23.69 
 
 		 562 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  21.63 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  21.16 
 
 		 811 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  22.41 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  38.2 
 
 		 647 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  38.2 
 
 		 647 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  36.96 
 
 		 645 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  20.32 
 
 		 448 aa  62  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.09 
 
 		 444 aa  62  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  22.62 
 
 		 609 aa  60.1  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  20.87 
 
 		 569 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  44.93 
 
 		 508 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  23.12 
 
 		 511 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  26.8 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  20.68 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.62 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  32.1 
 
 		 440 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  23.76 
 
 		 520 aa  57  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  37.5 
 
 		 647 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  26.79 
 
 		 565 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.04 
 
 		 642 aa  56.6  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  43.28 
 
 		 508 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  40.85 
 
 		 639 aa  55.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.04 
 
 		 643 aa  54.7  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  22.59 
 
 		 481 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.24 
 
 		 640 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  47.37 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  36 
 
 		 381 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  20 
 
 		 506 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  23.6 
 
 		 989 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>