172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0519 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  857    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  63.05 
 
 		 410 aa  546  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  58.02 
 
 		 409 aa  481  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  53.53 
 
 		 436 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  50.38 
 
 		 412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  39.17 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  36.39 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  35.53 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  29.17 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  32.26 
 
 		 436 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  31.46 
 
 		 448 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  30.91 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  28.86 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  30.02 
 
 		 435 aa  153  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  29.53 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  31.16 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  29.31 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  28.89 
 
 		 419 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  28.94 
 
 		 427 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  29.28 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  26.68 
 
 		 432 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  30.65 
 
 		 427 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  29.82 
 
 		 450 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  28.6 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  28.92 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  30.49 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  28.27 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3309  amine oxidase  26.81 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  26.99 
 
 		 445 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  26.99 
 
 		 445 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  26.99 
 
 		 445 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  30.41 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  33.33 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  48.05 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  26.29 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  29.49 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  35.16 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  35.16 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  24.95 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  26.8 
 
 		 591 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  45.45 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  45.45 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  35.94 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  25.25 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  25 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  19.7 
 
 		 466 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  23.6 
 
 		 482 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  44.16 
 
 		 499 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  23.29 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  24.35 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  23.3 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  20.67 
 
 		 722 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  19.42 
 
 		 466 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  41.86 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  19.7 
 
 		 466 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  25.31 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  28.37 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  40.74 
 
 		 477 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  19.4 
 
 		 466 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  35.79 
 
 		 647 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  36.67 
 
 		 489 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  35.79 
 
 		 647 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  40.24 
 
 		 645 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  38.37 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  39.02 
 
 		 647 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  29.08 
 
 		 479 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  36.05 
 
 		 455 aa  53.5  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  35.56 
 
 		 454 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  39.53 
 
 		 453 aa  53.1  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  25.53 
 
 		 437 aa  53.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  24.19 
 
 		 479 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  25.59 
 
 		 475 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  19.4 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  19.33 
 
 		 466 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  19.4 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  25.59 
 
 		 475 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  35.56 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  35.56 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  25.99 
 
 		 783 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  25.08 
 
 		 490 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  38.27 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  24.44 
 
 		 474 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  36.05 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  19.93 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  21.63 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  35.83 
 
 		 639 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  22.65 
 
 		 495 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  21.41 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  37.21 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  21.38 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  23.71 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  22.73 
 
 		 455 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  29.79 
 
 		 482 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  20.45 
 
 		 463 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  25.27 
 
 		 481 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  20.93 
 
 		 463 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  21.56 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  26.9 
 
 		 648 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  24.9 
 
 		 589 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  25.93 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>