211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4330 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  74.35 
 
 		 503 aa  783    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  100 
 
 		 500 aa  1033    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  70.06 
 
 		 520 aa  714    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  44.15 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33779  predicted protein  38.5 
 
 		 578 aa  297  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  37.05 
 
 		 544 aa  290  4e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  38.17 
 
 		 543 aa  287  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1346  zeta-carotene desaturase-like  37.24 
 
 		 543 aa  286  5.999999999999999e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10438  PDS-like 1, phytoene desaturase-like protein, phytoene dehydrogenase-like protein  37.25 
 
 		 545 aa  280  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54051  pds-like2, phytoene desaturase-like protein  32.58 
 
 		 605 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.250882  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43187  predicted protein  31.5 
 
 		 557 aa  209  9e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  27.38 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  25.97 
 
 		 552 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  25.05 
 
 		 599 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  25.36 
 
 		 482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  25.1 
 
 		 486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  25.21 
 
 		 490 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  25.26 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  25.21 
 
 		 490 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  27.14 
 
 		 453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  24.5 
 
 		 624 aa  127  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  23.91 
 
 		 499 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  27.19 
 
 		 455 aa  127  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  24.84 
 
 		 488 aa  123  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  25 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.97 
 
 		 474 aa  123  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  24.74 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  24.79 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.9 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  24.69 
 
 		 479 aa  121  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  23.59 
 
 		 484 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  24.07 
 
 		 489 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  26.33 
 
 		 453 aa  120  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  25.96 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  26.24 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  24.06 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  25.74 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  23.38 
 
 		 484 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  25.58 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  25.46 
 
 		 475 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  26.23 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  23.65 
 
 		 488 aa  117  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  24.62 
 
 		 472 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  24.85 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  23.83 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  24.43 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  26.64 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  25.42 
 
 		 589 aa  114  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  22.7 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  27.15 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  25.86 
 
 		 472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  25.69 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.79 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  25.56 
 
 		 460 aa  110  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  23 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  24.39 
 
 		 591 aa  106  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.78 
 
 		 466 aa  106  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  23.72 
 
 		 473 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  24.3 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.48 
 
 		 466 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  23.73 
 
 		 461 aa  103  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  26.19 
 
 		 523 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  22.65 
 
 		 481 aa  100  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  23.34 
 
 		 490 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  26.16 
 
 		 462 aa  97.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  25.64 
 
 		 462 aa  96.7  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  24.17 
 
 		 506 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  24.41 
 
 		 460 aa  90.9  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  23.66 
 
 		 506 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  23.66 
 
 		 506 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  25.25 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  26.03 
 
 		 508 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  24.95 
 
 		 546 aa  87  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  25.88 
 
 		 811 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.09 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  24.38 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  24.95 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  25.53 
 
 		 508 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  24.23 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  22.8 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  26.15 
 
 		 647 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.55 
 
 		 643 aa  77.8  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  26.15 
 
 		 647 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.14 
 
 		 639 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  23.6 
 
 		 647 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  24.5 
 
 		 519 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  25.81 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  23.8 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  28.26 
 
 		 639 aa  70.1  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.14 
 
 		 640 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  25.47 
 
 		 645 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  22.83 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  25.22 
 
 		 648 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.88 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.1 
 
 		 642 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  25.1 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  25.1 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  25.1 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  22.98 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.68 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>